黑龙江最好的一本大学是哈尔滨工业大学，哈工大已有材料科学、工程学、物理学、化学、计算机科学、环境与生态学、数学、生物学与生物化学等8个学科进入ESI全球前1%的研究机构行列。
黑龙江共有6所一本大学参与了2016黑龙江一本大学排名，其中排名第一的是哈尔滨工业大学，排名第二的是哈尔滨工程大学，排名第三的是东北林业大学，排名第6的大学还有黑龙江大学、哈尔滨医科大学、东北农业大学。
哈尔滨工业大学(Harbin Institute of Technology)，简称“哈工大(HIT)”，坐落于中国北方冰城哈尔滨市，中华人民共和国工业和信息化部直属重点大学，首批“211工程”、“985工程”重点建设院校，“九校联盟(C9)”、“中俄工科大学联盟”、“中国-西班牙大学联盟”主要成员，国家首批“111计划”、“2011计划”、“千人计划”、“卓越计划”入选高校，中管副部级建制，由工业和信息化部、教育部、黑龙江省人民政府三方重点共建。
哈尔滨工业大学溯源于1920年创办的哈尔滨中俄工业学校，建校初衷为培养铁路工程技术人才；而后历经“中俄工业大学校”、“哈尔滨工业大学校”、“哈尔滨高等工业学校”等多个阶段，学校在1938年1月正式定名为哈尔滨工业大学，沿用至今。
截止2015年7月，哈工大已有材料科学、工程学、物理学、化学、计算机科学、环境与生态学、数学、生物学与生物化学等8个学科进入ESI全球前1%的研究机构行列，其中材料科学、工程学已进入全球前1‰的研究机构行列。该校拥有哈尔滨本部及哈尔滨工业大学(威海)、哈尔滨工业大学深圳研究生院三个校区，共有全日制学生31903人，其中本科生16718人、研究生13263人(含硕士生7585人、博士生5678人)，留学生1922人。
哈尔滨工程大学，前身“中国人民解放军军事工程学院”(世称“哈军工”)，陈赓大将为首任校长、正大军区级单位(与教育部同级)，现隶属于工信部，是“国防七校”、“东北五校”之一，以“三海一核”为办学特色，是我国“三海一核”领域最大的高层次人才培养基地和重要的科学研究基地，被国家授予“航母建设突出贡献奖”唯一获奖院校。
学校是国家“首批27所211工程”、“985工程优势学科创新平台”、“56所研究生院”、“1959年首批20所全国重点大学”、“1960年64所全国重点大学”、“1978年88所全国重点大学”之一，是“国际船舶与海洋工程创新与合作联盟”、“中国船舶与海洋工程大学联盟”牵头高校，是“中俄工科大学联盟”创始成员之一，入选国家“111计划”、“卓越工程师教育培养计划”、“21世纪人才强军计划”、“国家建设高水平大学公派研究生项目”计划，学校由国防科工委、海军、教育部、黑龙江省四方重点共建。
1970在“哈军工”原址，以海军系、原子系、导弹系战术导弹分部为基础，组建哈尔滨船舶工程学院(简称“哈船舶”)，1978年再次被评为全国重点大学，1994年更名为哈尔滨工程大学。
学校现有教职工3083人，其中专任教师1800人，博士生导师377人(不含兼职)，院士16人(全职+共享+外籍)973首席科学家12人，千人计划5人，长江学者10人，本科生14949人，硕士研究生8550人，博士研究生1783人，外国留学生1056人，2015年科研经费立项突破11亿元。
东北林业大学（Northeast Forestry University）学校前身东北林学院创建于1952年，以浙江大学农学院森林系和东北农学院森林系为基础建立，1985年，更名为东北林业大学。
是中华人民共和国教育部直属的一所以林业工程为特色，农、理、工、经、管、文、法、医、艺相结合的多科性全国重点大学，是国家“211工程”、“985工程优势学科创新平台”重点建设院校，是高水平行业特色大学优质资源共享联盟成员高校，入选“2011计划”、“卓越工程师教育培养计划”、“111计划”，“卓越农林人才教育培养计划”，国家林业局、黑龙江省人民政府三方共建高校，设有研究生院。
学校地处中国最大国有林区的中心——哈尔滨市，截至2014年3月，校园占地136公顷，并拥有帽儿山实验林场（帽儿山国家森林公园）和凉水实验林场（凉水国家级自然保护区）等教学、科研、实习基地，总面积达3.3万公顷，各类在校学生4万多人。