1、原料不同。玉米淀粉：从玉米中提取的淀粉，又称玉蜀黍淀粉。俗名六谷粉。小麦淀粉：从小麦中提取淀粉，过去是采用发酵法，即将小麦加水浸软、磨碎后， 进行加酸发酵，使包围在淀粉颗粒周围的细胞被溶解而淀粉易于分离。
2、颜色不同。玉米淀粉：原材料是是玉米，白色微带淡黄色的粉末。小麦淀粉：原材料是小麦，白色粉末。
3、提取方法不同。玉米淀粉：将玉米用0.3%亚硫酸浸渍后，通过破碎、过筛、沉淀、干燥、磨细等工序而制成。小麦淀粉：以小麦面粉为原料，在搅合机中加水50～80%，以40转/分的转速使面粉捏合成面团。搅合时间约30分钟，放置30分钟，使面筋膨润而互相粘结，使淀粉易于分离。